La terminazione avviene quando nel sito A entra uno dei tre codoni di stop: il ciclo di allungamento si arresta e la traduzione ha termine (▶figura 12). Questi codoni, UAA, UAG e UGA, non codificano nessun amminoacido e non si legano a un tRNA. Si legano invece a un fattore di rilascio che consente l’idrolisi del legame fra la catena polipeptidica e il tRNA presente nel sito C.

A questo punto il polipeptide appena terminato si separa dal ribosoma; come terminale C ha l’ultimo amminoacido che si è unito alla catena, mentre come terminale N, almeno inizialmente, ha una metionina, dato che il codone di inizio è AUG. L’informazione che stabilisce quale configurazione debba poi assumere e quale sia la sua destinazione cellulare definitiva è già contenuta nella sua sequenza amminoacidica. I segnali di inizio e di terminazione della trascrizione e della traduzione sono riassunti nella ▶tabella 1.